Декодер ДНК у облику УСБ флеш диск

• ДНК декодер као УСБ-фласх

У Великој Британији, он је створио најмањи аутоматско дешифровање генома у свету. Он ће се појавити на полицама ове године, и - са атрактивном ценом. Компанија ће бити мање занимљиво ДНК анализатор, затвореник на серверу.

Компанија Окфорд Нанопоре Тецхнологиес уводи минијатурни једнократну одлучујући секвенцу база у ДНК молекулу - Минион.

Потпуно аутономни приборцхик величине мало веће меморије флеш дискови, прикључени на УСБ порт на лаптоп или ПЦ. Он садржи све елементе потребне за комплетну генома: микропотоковие систем, јединствене сензоре и специјализованих електронику.

Тачност Бегиннер - ниво редоследу постојећих система, креатори уређаја тврде.

Уређај производи директно очитавање "слова" ДНК у реалном времену их одражавају на екрану, као и евиденцију у меморији рачунара.

Истраживачи могу да одреде унапред колико им је информација потребна за потребе једног искуства, или фрагмент генетског кода, они траже и зауставити транскрипт од постизања резултата, брзо оде у нови експеримент.

Припрема узорака за МиниоН система и не захтева много труда. Уређај ради са двоструког ланца ДНК, штавише не захтевају претходни амплификацију.

У неким случајевима сензор може одмах разликовати молекул из крви или серума узорак, а понекад може бити потребно мало смешу предтретман.

Још интересантније је да је уређај миљеник споредни пројекат, рођена да створи већи, снажнији за вишекратну употребу система редослед - ГридИОН. Оба користе исту технологију да дешифрује геном, на којој је група биохемичара из Велике Британије и Сједињених Америчких Држава радио око 20 година (рачунајући од појаве голом идеје). Механизам се заснива на полимерној мембрани са уграђеним нано-поре. Овај део уређаја добија комбинацију природних (протеина) и синтетичких молекула.

Нанопорес мембране пројектован да се изоставе неки строго молекул.

Специјално развијена Раствор ензима је додат узорак, и узима ДНК молекул узастопно је гура кроз поре је преко брадавица паука (види слику горе).

У овом тренутку, пора је повезан са електронски коло детектује електричне осцилације. Према њиховим специфичним профилом сваки уређај израчунава последњу базу пар, и са високом прецизношћу чак и за веома дуге фрагмената "молекул живота".

протеин нанопоре мембране. После иде ион струја, које се јављају "прекид", које се разликују у зависности од врсте која пролази кроз "Капија" молекула. Према степену угиба текућих електронике идентификује основне ДНК базе.

За разлику од свог колеге мали ГридИОН систем је нека врста сервер-декодера комплекс (компанија назива своје чворове - ГридИОН чвор).

Сваки чвор има слот за једнократну кертриџа. Потоњи обухвата читав низ реагенаса потребних за комплетну анализу ДНК, као и стварну чип анализатор с две хиљаде нанопорес описаних горе.

Ноде ГридИОН ноде прецизно мерење јонски струја унутар чипа, декодира их и приказује резултат секвенцирања. У паралелном низу генетски код се снима на спољном чврстом диску или неком другом рачунару (преко УСБ-а или мреже). Више од једне Дан ГридИОН чвор може да издаје десетине гигабајта на подацима базна секвенца у посматраном ДНК.

ГридИОН јединица може се конфигурисати за претраживање не само узорак и ДНК анализу, али и друге молекуле - научник релевантне протеине или, на пример, експлозивне једињења.

Иако је "сервер" ГридИОН чвор је у стању да функционише као самостални десктоп опреме, најупечатљивија резултат се постиже када се неколико таквих уређаја комбинују у Сервер Рацк (стандардна ширина од 19 инча) и делују заједнички, размјену података директно током декодирање.

(Узгред, димензије и конектори ГридИОН чвор одговарају заједничком серверу.)

за ГридИОН патрона.

Модел 2013 верзија је због оут ГридИОН чвор већ у 8000 нанопоре, и требало би да ради брже од претходног модела.

Према произвођачу, 20 ових машина на серверу сталак ће бити у стању да декодира читав геном једне особе за само 15 минута.

Оба уређаја, и ГридИОН (прва верзија), као и упадљива Минион, треба да ослободи на тржишту у 2012. години. Произвођач намерава да успостави конкурентну цену, у поређењу са најновијим технологијама високе брзине декодирање генома.

Конкретно, "ДНК секвенцер - флеш" ће коштати мање од $ 900.

"сервер" ГридИОН чвор и скуп чворова на серверу сталак. Један ГридИОН чвор троши мање од 50 вати, компанија наглашава једна од предности овог уређаја.

Овде морамо имати на уму да је мало више од годину дана пре америчке компаније Лифе Тецхнологиес уводи десктоп лични геном дешифровање Личне Геном Мацхине, у вредности од најмање $ 100 хиљада. Принцип примононни у томе разликује од ГридИОН технологије, али постоје заједнички: за аутоматско секвенционирање, научници су развили микрочип који комбинује електроника са хемијом.

У јануару 2012., Лифе Тецхнологиес (или боље речено, његово зависно привредно друштво ион Торент) показала је свој нови модели декодер геном по имену Јон протона. Ова машина је већ процењује на $ 149,000, али је чип анализатор, крије унутра, је 1.000 пута јачи од претходног узорка.

Апарат ион Протон је у стању да прочита цео људски геном у дану по цени од "потрошног" $ 1,000.

Све ове уређаје треба елиминисати, како кажу научници, једна од уских грла у великом броју биолошких и медицинских истраживања - спор декодирање генома.

Сада, овај задатак може да на релативно малом лабораторији, а у случају декрипцији, фласх дискове може се рећи да је ДНК технологија декодирања је на ивици долази скоро сваки дом, баш као што је садржај шећера сада људи независно анализира крв.